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Formation mixOmics Septembre 2015

Objectifs
Introduire les concepts fondamentaux de l’analyse statistique multivariée. Présentation de méthodes multivariées innovantes pour l’exploration et l’intégration de données « omiques » (transcriptomique, protéomique, métabolomique, métagenomique…) mesurées sur les mêmes individus.
Présentation et illustration sur plusieurs cas d’étude biologiques de sept types de méthodes multivariées et leurs variantes « sparse » implémentées dans mixOmics afin de sélectionner un sous ensemble de variable pertinent (gènes, métabolites, protéines …) caractérisant le système biologique étudié.

Public concerné
Personnel scientifique et technique

Pré-requis
Pratique du logiciel R

Programme (alternance de théorie et pratique, les parties pratiques se dérouleront sur l’ordinateur portable des participants)

  1. Les méthodes dans mixOmics et leurs variantes ‘sparse’
    • Exploration d’un seul jeu de données
    • Sélection de variable biologiques pour discriminer différent groupes d’individus
    • Intégration de deux jeux de données ‘omiques’ et sélection de variables durant le processus d’intégration
    • Analyse de données répétées
    • Introduction a l’intégration de plus de deux jeux de données « omiques »
  2. Les sorties graphiques implémentées dans mixOmics
    • Représentation des individus
    • Représentation des variables lors du processus d’intégration
  3. Cas d’études et applications
    • Cinq cas d’études seront présentés pour illustrer les différentes méthodes multivariées

Intervenants
Kim-Anh Lê Cao, …

Dates et horaires
lundi 14 septembre 2015 : de 9h à 17h
mardi 15 septembre 2015 : de 9h à 17h

 Tarif
Académique : 250 € HT
Non académique: 600 € HT

Inscription et modalités de paiement
Les demandes d’inscription doivent être envoyées par mail à l’adresse  biostat@math.univ-toulouse.fr en précisant {Nom, prénom, organisme/laboratoire}. Toute demande d’inscription est à confirmer par l’envoi d’un bon de commande  (+TVA 20 % pour non INRA, sans TVA pour INRA) à l’adresse

INRA-MIAT – PF BIOSTATISTIQUE
Chemin de Borde Rouge
CS 52627 – Auzeville
31326 Castanet Tolosan – France

ou par mail à secretariat-miat(at)toulouse.inra.fr

Informations bancaires

domiciliation: TP Toulouse
bank code: 10071
counter code: 31000
bank account number: 00001002650  – key : 96
bank postal address: INRA TOULOUSE AC SECONDAIRE – Chemin de BORDE ROUGE – CS 52627 – 31326 CASTANET TOLOSAN CEDEX
IBAN: FR76 1007 1310 0000 0010 0265 096
BIC: TRPUFRP1

Autres informations
N° SIRET INRA Toulouse: 18007003901134
APE code: 731 Z

Conditions d’annulation
En l’absence d’annulation par mail avant le 1er septembre, le paiement sera dû.

Contacts et informations
biostat@math.univ-toulouse.fr



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