Projets de recherche

En cours

  1. FAIROmics – FAIRification of multiOmics data to link databases and create knowledge graphs for fermented foods 2023-2027. HORIZON-MSCA-2022-DN-01-01
  2. M4DI – Methods and Models for Multimodal and Multi-scale Data Integration 2024-2027. PEPR Santé Numérique.
  3. MercurFood – Fate and impact of MERCURy in aquatic FOOD chains in an exposome context. ANR AAPG 2023.
  4. E-MUSE – Complex microbial Ecosystems MUltiScale modElling: mechanistic and data driven approaches integration 2021-2024. MSCA-ITN-2020 European Training Network.

Archives

  1. ASTERICS – A tool for the exploration and integration of omics data, 2020-2022. Financement : Région Occitanie
  2. FUJI – Effect of dietary supplementation with fermented fruit juices on human gut microbiota composition and function, and on host response, 2018-2019. Financement : Inra (départements AlimH, CEPIA, MICA)
  3. METAhCOL – Impact of low doses mixtures of aromatic hydrocarbon on colon carcinogenesis process: focus on energy metabolism hallmark, 2017-2019. Financement : ITMO Cancer Environnement.
  4. Voice4PD-MSA – Differential diagnosis between Parkinson’s disease and Multiple System Atrophy using digital speech analysis, 2016-2020. Financement : Agence Nationale de la Recherche (ANR), AAP Technologies pour la santé.
  5. BIDASA – Big Data en Santé : Fusion de Bases et Essais Cliniques Simulés, 2017-2018. Financement : CNRS, Défi interdisciplinaire « Mastodons ».
  6. Big Data en Santé Publique, 2015-2018. Financement : Région Occitanie, AAP Recherche Biomédicale.
  7. WallOmic – Production et traitement de données « omics » hétérogènes en vue de l’étude de la plasticité de la paroi chez des écotypes pyrénéens de la plante modèle A. thaliana, 2014-2017. Financement : Région Midi-Pyrénées et Université Fédérale Toulouse Midi Pyrénées.
  8. « SYNTHACs »  – Biologie synthétique pour la synthèse de molécules chimiques à haute valeur ajoutée à partir de ressources carbonées renouvelables, 2012-2016. Financement : Agence Nationale de la Recherche (ANR), Investissement d’avenir,  Programme Biotechnologies et Bioressources.
  9. « MatMyb » – Vers la modélisation mathématique du réseau transcriptionnel contrôlé par AtMYB30, un facteur de transcription associé à la réponse de défense chez la plante modèle, 2013-2016. Financement : Région Midi-Pyrénées et département Santé des Plantes et Environnement de l’INRA.
  10. « CM2BI » – Couplage de méthodes et modèles pour la biologie intégrative. Projets exploratoires pluridisciplinaires inter-instituts (PEPII), CNRS (INSB, INEE, INSMI, INS2I).
  11. « Proliphyc » – Étude de la Protéomique Liquidienne Pour l’Hydrocéphalie, 2010-2012. Financement : Programme Hospitalier de Recherche Clinique, PHRC.
  12. « Protell » – Biomarkers identification in CNS relapse of diffuse large B cell lymphomas, 2010-2012. Financement : Institut National du Cancer, INCa.
  13. Evaluation d’un moteur de recherche et de recommandation par l’analyse de journaux (logs), 2010-2011. Financement : Région Midi-Pyrénées.
  14. « CAAS » – Analyse Contextuelle et Recherched’information Adaptative, 2010-2012. Financement : ANR, Programme CONTENUS ET INTERACTIONS.
  15. « Plast-Impact » – Impacts métabolique et endocrinien de deux contaminants de la chaîne alimentaire issus de la plasturgie : le Bisphénol A et le DEHP (diéthylhexyl phtalate), 2006-2009. Financement : ANR, Programme National de Recherches en Alimentation et Nutrition Humaine.
  16. « ACRIC » – Analyse Canonique et Recherche d’Information Contextuelle, 2007-2008. Financement : Programme Pluri-Formations de Recherche en Mathématiques et Informatique de Toulouse (FREMIT).
  17. Transcriptome vs protéome, un examen des régulations traductionnelles par une approche de biologie intégrative chez Lactococcus lactis, 2006-2008. Financement : Programme Fédérateur INRA AgroBI (Biologie intégrative animale, végétale et microbienne).
  18. « Microméga » – Modélisation des dynamiques microbiennes par systèmes multi-agents adaptatifs intégrant les données macroscopiques et moléculaires, 2006-2008. Financement : ANR, programme blanc.
  19. « ENV-STAT-EXP » – Développement d’un environnement dédié à l’analyse statistique des données d’expression 2004-2007. Financement : Action Concertée Incitative, Informatique, Mathématiques, Physique en Biologie moléculaire (ACI IMPBio).
  20. Calcul du gabarit de la signature infra-rouge d’un aéronef, 2005-2007. Financement  : Office National d’Etudes et Recherches Aérospatiales (ONERA).
  21. Méthode et outils de fouille de texte pour les projets spatiaux, 2004-2007. Financement :  Centre National d’Etudes Spatiales (CNES).