Sont reportées sur cette page les actions menées autour du traitement des données Single Cell RNA-seq.
- Shiny app ASTEC-sc :ASTEC-sc : A Shiny application To Explore Clusterings of single cell RNA seq data. This application allows to visualize cells in dimensionality reduction methods and expressed genes, to compare cell clusterings and to determine marker genes.Cette application a été développée par Nicolas Enjalbert-Courrech dans le cadre de son stage de M1, co-encadré avec S. Déjean. Elle sera prochainement disponible.
- Projet Single Cell (TTIL 2018 INP-INSA-ISAE) porté par Sandrine Laguerre et Cathy Maugis-Rabusseau.
- Journée toulousaine Single Cell RNA-seq du 18 octobre 2018 à l’INSA Toulouse:cette première journée a rassemblé une quarantaine de participants
orateurs: Delphine Labourdette (LISBP), Jean-Jacques Fournié (CRCT), Céline Mazzotti (CRCT-IUCT) et Cathy Maugis-Rabusseau (INSA/IMT)
L’ensemble du programme et les présentations sont accessibles à l’adresse suivante : Lien - Journée toulousaine SingleCell RNA-seq du 4 juillet 2019 à l’INSA Toulouse(Lien)
- Sujet de stage « Analyses statistiques de données single-cell RNA-seq. Application à l’étude des cellules stromales mésenchymateuses » proposé par le STROMALab et l’IMT : sujetstage-singlecell-stromalab-2019
- Journée toulousaine Single Cell RNA-seq du 18 octobre 2018 à l’INSA Toulouse:cette première journée a rassemblé une quarantaine de participants