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Workshop Bioinfo-Biostat, 17-18 janvier 2018

Journées Bio-informatique / Bio-statistique GenoToul, CIMI, Onconet Sudoe, 17-18 janvier 2018

Web site: http://www.cimi.univ-toulouse.fr/mib/en/workshop-bioinfobiostat

This event organised in 2018, in addition to GenoToul, by the labex CIMI and by the Onconet Sudoe project, is the opportunity to continue a series of meetings and exchanges between bio-informatics, bio-statistics and biology teams. Exchanges concern methodological researches as well as data analysis through the development of appropriate bioinformatic and biostatistics tools. We invite all researchers and engineers (academic and private companies) to submit an abstract (1 page, preferably in English) for an oral or poster contribution.

Ces journées co-organisées cette année, en plus de GenoToul, par le labex CIMI et par le projet Onconet Sudoe sont l’occasion de poursuivre une série de rencontres et d’échanges entre les équipes de (bio)informatique, de (bio)statistique et de biologie, aussi bien dans le cadre de leur activité de recherche méthodologique que, sur le plan opérationnel, de l’exploitation des données par la mise oeuvre ou le développement d’outils bioinformatiques – biostatistiques appropriés. Nous invitons l’ensemble des chercheurs et ingénieurs (organismes publics et entreprises privées) à proposer une présentation sous forme d’un résumé (1 page, de préférence en anglais) pour une contribution orale ou par affiche.

Calendrier / Schedule :
– Date limite de soumission des résumés / Deadline for abstract submission : 17 novembre
– Confirmation de l’acceptation pour une sélection orale ou par poster / Confirmation of the selection for oral or poster communication : 1er décembre

Lieu / Location : université Paul Sabatier, Institut de Mathématiques, amphithéâtre L. Schwartz (bâtiment 1R3)

Les inscriptions sont gratuites mais obligatoires. Les pauses et repas de midi seront pris en charge. / Registration is free but mandatory. Coffee breaks and lunch are supported by the organization.

Posted in Animation.


Formation mixOmics 9-10 novembre

Dans le cadre d’un projet « Professeurs Invités de l’INP », Kim-Anh Le Cao de l’université de Melbourne en Australie sera à Toulouse du 23 octobre au 10 novembre 2017.

Kim-Anh Le Cao et Sébastien Déjean organisent une formation de 2 jours les 9 et 10 novembre 2017 sur le logiciel MixOmics. Cette formation est destinée en priorité aux étudiants, doctorants et post-doctorants mais est également ouverte aux chercheurs. A ce jour (6 octobre), il reste quelques places.

Toutes les informations sont disponibles à l’adresse suivante :

http://mixomics.org/2017/06/9-10-nov-2017-toulouse/

Posted in Formation.


Participation à l’école d’automne CIMI

La plateforme biostatistique de Toulouse participera à l’école d’automne organisée par le labex CIMI dans le cadre du semestre thématique « mathématiques, informatique et biology ». Sébastien Déjean et Nathalie Villa-Vialaneix présenteront un tutoriel intitulé « An introduction to network analysis » qui aura lieu le mardi 19 septembre de 15h45 à 17h45.

Plus d’informations sur cette page.

Il reste des places et les inscriptions sont à effectuer par simple e-mail aux organisateurs.

Posted in Formation.


Formation « Graphiques avancés avec R »

Une formation aux outils de graphiques avancés (ggplot2, graphiques interactifs) avec R aura lieu

le 27 octobre 2017, à l’INRA de Toulouse

Pré-requis : Utilisateurs de R ayant déjà une connaissance des outils graphiques de base. Ce cours n’inclut pas une formation plus théorique en visualisation de données.

Télécharger le syllabus ici.

Inscription avant le 30 septembre ici.

Cette formation est organisée en coordination avec

miat          imabs

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Formation « Statistique niveau 2 » – juin 2017

Une formation aux outils statistiques de base pour l’analyse de données avec R aura lieu

du 19 au 22 juin 2017, à l’INRA de Toulouse

Pré-requis : Utilisateurs de la statistique (chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants) ne possédant pas de formation particulière en mathématiques mais ayant acquis les notions de base du module 1. Une connaissance basique de R est un plus.

Télécharger le syllabus ici.

Inscription avant le 30 mai ici.

Cette formation est organisée en coordination avec

miat          imabs

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1-year postdoctoral position – INRA GenPhySE Toulouse

A 1-year postdoc position is available at INRA GenPhySE Toulouse on the topic of « Identification of biomarkers and development of a bio-statistics tool to predict pig digestive health from microbiota ».

Duration: 1 year
Requirement: PhD degree in biology or biostatistics
Starting date: April, 2017

Job description

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Formation « Statistique niveau 1 » – mars 2017

Une formation d’initiation à la statistique avec R aura lieu

les 2 et 3 mars 2017, à l’INRA de Toulouse

Pré-requis : aucun. Le module s’adresse aux débutants et sera illustré avec le logiciel R Commander qui est une interface graphique intuitive pour R permettant de faire ses premiers pas avec le logiciel.

Télécharger le syllabus ici.

Inscriptions closes.

Cette formation est organisée en coordination avec

miat          imabs

Posted in Formation.


CDD IE biostatistique / transcriptomique – 1 an reconductible

Un poste de CDD IE biostatistique est à pourvoir sur le site TRiX de la plateforme technologique GeT et hébergé au sein de l’unité de recherche ToxAlim. Le plateau GeT-TRiX propose notamment un service d’analyses transcriptomiques « clé en main » par la technologie des puces à ADN (microarray) : du contrôle qualité des échantillons biologiques jusqu’à la réalisation d’analyses biostatistiques des données produites. Le plateau a mis en place un service d’analyse biostatistique de données transcriptomiques via l’utilisation de packages dédiés sous environnement R et en développant des scripts d’analyse afin de traiter les données ; depuis leur contrôle qualité jusqu’aux analyses différentielles, multivariées ou également d’enrichissement fonctionnel. En parallèle, le plateau souhaite développer une expertise dans l’analyse d’intégration de données multi « omiques ». Le/la candidat/e sera encadré par l’Ingénieur en traitement de données, également responsable du plateau. Il/elle aura pour mission de prendre en charge les analyses réalisées sur le plateau ainsi que la mise en place de nouvelles méthodes d’analyse de données « omiques ».

Durée du poste : 1 an, renouvelable, à partir de mars 2017

Contacts : yannick.lippi[AT]inra.fr ; get-trix[AT]genotoul.fr

Profil détaillé du poste

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2-year postdoctoral position in statistics – INRA/ENVT

This 2-year postdoc position is part of a project called “PigletDetect”. This project is funded by the
Carnot Institute and gathers one research teams, one professional institute (IFIP – The French Pork and Pig Institute) and one manufacturer (ASSERVA).

Duration: 2 years
Requirement: PhD degree in mathematics or statistics
Starting date: June 1, 2017

Job description

Posted in Stage / Emploi.


2-year postdoc position in inferring gene regulatory network of sunflower

Postdoctoral position  on structure  learning of  transcription factor network related to  heterosis in sunflower available at  the INRA MIAT laboratory in France (near Toulouse)

Continued…

Posted in Stage / Emploi.




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