Intégration de données omiques avec mixOmics et mixKernel
L’objectif de cette formation est la découverte des packages mixOmics et mixKernel (logiciel R) et des analyses statistiques multivariées qu’ils permettent de réaliser pour l’exploration d’un ‘omique et l’intégration de plusieurs ‘omiques (transcriptomique, métabolomique, protéomique, …).
Prochaine session : 19-20 juin 2023 à INRAE Auzeville, salle de formation du bâtiment C8/MIAT, si les conditions sanitaires le permettent. Pour s’inscrire,. Pour s’incrire, remplir ce formulaire.
Pré-requis : Bases en statistique et programmation R.
Notions abordées :
- Analyse multivariée non supervisée (ACP)
- Analyse multivariée supervisée (PLS-DA)
- Analyse multivariée intégrative (PLS, CCA, multi-blocs)
- Méthodes parcimonieuses pour la sélection de variables
- Analyse multi-tableaux à noyau (ACP à noyau)
Intervenants : Sébastien Déjean (Université Paul Sabatier, IMT), David Rengel (CNRS, IPBS) et Jérôme Mariette (INRAe, MIAT)
Durée de la formation : 2 jours
Coût : Académiques : 500€ HT – Secteur privé : 1000€ HT – Agents INRAe Toulouse : nous contacter
Cette formation est organisée en coordination avec
