Machine et deep learning avec R (Keras)
La formation a pour objectif la mise en œuvre pratique, avec R (librairie Keras), d’approches de machine learning et de deep learning pour résoudre des problèmes d’apprentissage automatique rencontrées en biologie moléculaire et génétique humaine.
Prochaine session :Dates à venir pour 2023. La formation aura lieu à INRAE Auzeville, salle de formation du MIAT. Pour s’inscrire, remplir ce formulaire.
Pré-requis : La formation s’adresse à des utilisateurs réguliers de R.
Notions abordées :
- Day 1 : Predict regulatory elements with ML and DeepL with machine learning approaches (SVM, K-mers, GLM, random forests) (3h) and with Deep Learning approaches (CNN, model interpretation) (3h)
- Day 2: Application to human genetics: SNPs from Genome-Wide Association Studies, and expression quantitative trait loci (eQTL or eSNP), Prediction of SNP effect using deep learning for variant prioritization and understanding of biological mechanisms (3h)
Intervenants : Raphaël Mourad (CBI, Université Toulouse 3, actuellement en délégation à MIAT-MathNum)
Durée de la formation : 1,5 jour
Horaire: 9h-17h (J1); 9h-12h (J2)
Coût : Académiques : 150€ HT / jour – Secteur privé : 300€ HT / jour – Agents INRAe Toulouse : nous contacter
Cette formation est organisée en coordination avec
